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一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法及裝置與流程

文檔序號(hào):40743361發(fā)布日期:2025-01-21 11:33閱讀:17來源:國知局
一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法及裝置與流程

本發(fā)明涉及反應(yīng)條件預(yù)測(cè),具體涉及一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法及裝置。


背景技術(shù):

1、在化學(xué)領(lǐng)域的合成任務(wù)中,目標(biāo)化合物往往是通過一系列的化學(xué)合成最終得到的。在合成過程中,提高合成的產(chǎn)率尤為重要,只有高產(chǎn)率的合成路線才會(huì)被化學(xué)家們接受并使用。為了提高反應(yīng)的產(chǎn)率,化學(xué)家們根據(jù)經(jīng)驗(yàn)去嘗試不同的反應(yīng)條件,直到產(chǎn)率達(dá)到要求為止。而這個(gè)過程往往需要漫長(zhǎng)的實(shí)驗(yàn)過程,需要大量的原料、人力和時(shí)間成本。此外,存在一些反應(yīng),盡管實(shí)驗(yàn)了大量的反應(yīng)條件無法得到的高產(chǎn)率,這樣的路線會(huì)被放棄。若存在一個(gè)方法能夠預(yù)測(cè)出反應(yīng)產(chǎn)率最高的反應(yīng)條件以及能達(dá)到的產(chǎn)率值,可以幫助化學(xué)家們節(jié)省非常多的實(shí)驗(yàn)時(shí)間,提高整個(gè)化學(xué)合成的效率。

2、如今,隨著深度學(xué)習(xí)的發(fā)展,用于反應(yīng)條件預(yù)測(cè)的方法有了很大進(jìn)展。然而,現(xiàn)有的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)方法的準(zhǔn)確度存在誤差,它們往往會(huì)推薦出多個(gè)反應(yīng)條件來提高模型命中率。但對(duì)于使用者來說,他們并不知道這多個(gè)反應(yīng)條件中最好的是哪一個(gè),所以仍然需要通過多次實(shí)驗(yàn)去確認(rèn)預(yù)測(cè)結(jié)果。

3、因此,如何發(fā)明一種推薦高產(chǎn)率反應(yīng)條件及其對(duì)應(yīng)產(chǎn)率值預(yù)測(cè)的方法,成為亟需解決的問題。


技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、為此,本發(fā)明提供一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法及裝置,通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)對(duì)推薦的反應(yīng)條件進(jìn)行排序,為使用者提供高產(chǎn)率的反應(yīng)條件,同時(shí)給出產(chǎn)率值來說明反應(yīng)的產(chǎn)率上限。

2、為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法,包括:

3、對(duì)原始數(shù)據(jù)集進(jìn)行篩選過濾處理,提取反應(yīng)的分子smiles、反應(yīng)條件和產(chǎn)率,生成樣本數(shù)據(jù)集;

4、將所述樣本數(shù)據(jù)集中同一反應(yīng)擁有若干反應(yīng)條件的樣本進(jìn)行處理,保留產(chǎn)率最大的樣本,生成反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集;

5、將所述樣本數(shù)據(jù)集中同一反應(yīng)擁有若干反應(yīng)條件的樣本進(jìn)行處理,保留全部樣本,生成反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集;

6、基于圖卷積網(wǎng)絡(luò)和非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)建反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型;通過所述反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集對(duì)所述反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練,獲得訓(xùn)練好的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型;

7、基于多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)建反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型;通過所述反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集對(duì)所述反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練,獲得訓(xùn)練好的反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型;

8、將目標(biāo)反應(yīng)的分子smiles輸入所述訓(xùn)練好的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型,通過所述訓(xùn)練好的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型進(jìn)行預(yù)測(cè)處理,獲得所述目標(biāo)反應(yīng)的反應(yīng)條件組合;將所述目標(biāo)反應(yīng)的分子smiles及所述反應(yīng)條件組合中的分子smiles,逐一輸入所述訓(xùn)練好的反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型,通過所述訓(xùn)練好的反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型進(jìn)行預(yù)測(cè)處理,獲得所述反應(yīng)條件組合對(duì)應(yīng)的產(chǎn)率;將所述反應(yīng)條件組合對(duì)應(yīng)的產(chǎn)率進(jìn)行排序,將產(chǎn)率最大的反應(yīng)條件組合作為推薦結(jié)果。

9、作為一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法的優(yōu)選方案,在生成所述反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集的過程中,將反應(yīng)的分子smiles作為輸入,反應(yīng)條件作為標(biāo)簽,生成所述反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集。

10、作為一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法的優(yōu)選方案,在生成所述反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集的過程中,將反應(yīng)及反應(yīng)條件的分子smiles作為輸入,反應(yīng)產(chǎn)率作為標(biāo)簽,生成所述反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集。

11、作為一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法的優(yōu)選方案,所述反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型的預(yù)測(cè)步驟為:

12、通過化學(xué)信息學(xué)工具對(duì)目標(biāo)反應(yīng)中的反應(yīng)物分子和產(chǎn)物分子進(jìn)行處理,生成所述反應(yīng)物分子的化學(xué)信息學(xué)特征和所述產(chǎn)物分子的化學(xué)信息學(xué)特征;將所述反應(yīng)物分子的化學(xué)信息學(xué)特征和所述產(chǎn)物分子的化學(xué)信息學(xué)特征進(jìn)行融合,生成反應(yīng)的特征表示;

13、構(gòu)建反應(yīng)物和產(chǎn)物的分子圖,將若干分子圖通過鄰接矩陣拼接得到反應(yīng)的分子圖;提取分子中每個(gè)原子的化學(xué)特征,組成與所述反應(yīng)的分子圖相對(duì)應(yīng)的特征矩陣;

14、將分子的化學(xué)信息學(xué)特征通過多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)處理,獲得基于分子的全局表示;

15、將所述反應(yīng)的分子圖及所述特征矩陣輸入多層圖卷積網(wǎng)絡(luò),通過聚合學(xué)習(xí)所述反應(yīng)的分子圖中原子之間的局部鄰居信息;將聚合后的原子表示通過平均池化層處理,得到基于原子的局部表示;

16、將所述全局表示及所述局部表示進(jìn)行組合,并通過若干預(yù)測(cè)層進(jìn)行處理,輸出若干反應(yīng)條件;將若干反應(yīng)條件進(jìn)行排列組合,生成若干反應(yīng)條件組合;

17、將所述反應(yīng)的特征表示通過多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)處理,輸出溫度預(yù)測(cè)值;

18、將若干所述反應(yīng)條件組合分別輸入多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行處理,輸出每個(gè)所述反應(yīng)條件組合對(duì)應(yīng)的溫度,獲得目標(biāo)反應(yīng)的若干目標(biāo)反應(yīng)條件。

19、作為一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法的優(yōu)選方案,所述反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型的預(yù)測(cè)步驟為:

20、根據(jù)目標(biāo)反應(yīng)的分子smiles和反應(yīng)條件的smiles計(jì)算,獲得化學(xué)反應(yīng)指紋;

21、將產(chǎn)率進(jìn)行歸一化處理;

22、將所述化學(xué)反應(yīng)指紋輸入多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),得到預(yù)測(cè)的產(chǎn)率。

23、本發(fā)明還提供一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦裝置,基于以上一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法,包括:

24、原始數(shù)據(jù)集處理模塊,用于對(duì)原始數(shù)據(jù)集進(jìn)行篩選過濾處理,提取反應(yīng)的分子smiles、反應(yīng)條件和產(chǎn)率,生成樣本數(shù)據(jù)集;

25、反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集生成模塊,用于將所述樣本數(shù)據(jù)集中同一反應(yīng)擁有若干反應(yīng)條件的樣本進(jìn)行處理,保留產(chǎn)率最大的樣本,生成反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集;

26、反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集生成模塊,用于將所述樣本數(shù)據(jù)集中同一反應(yīng)擁有若干反應(yīng)條件的樣本進(jìn)行處理,保留全部樣本,生成反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集;

27、反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型構(gòu)建及訓(xùn)練模塊,用于基于圖卷積網(wǎng)絡(luò)和非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)建反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型;通過所述反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集對(duì)所述反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練,獲得訓(xùn)練好的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型;

28、反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型構(gòu)建及訓(xùn)練模塊,用于基于多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)建反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型;通過所述反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集對(duì)所述反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練,獲得訓(xùn)練好的反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型;

29、反應(yīng)條件推薦獲取模塊,用于將目標(biāo)反應(yīng)的分子smiles輸入所述訓(xùn)練好的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型,通過所述訓(xùn)練好的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型進(jìn)行預(yù)測(cè)處理,獲得所述目標(biāo)反應(yīng)的反應(yīng)條件組合;將所述目標(biāo)反應(yīng)的分子smiles及所述反應(yīng)條件組合中的分子smiles,逐一輸入所述訓(xùn)練好的反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型,通過所述訓(xùn)練好的反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型進(jìn)行預(yù)測(cè)處理,獲得所述反應(yīng)條件組合對(duì)應(yīng)的產(chǎn)率;將所述反應(yīng)條件組合對(duì)應(yīng)的產(chǎn)率進(jìn)行排序,將產(chǎn)率最大的反應(yīng)條件組合作為推薦結(jié)果。

30、作為一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦裝置的優(yōu)選方案,所述反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集生成模塊中,在生成所述反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集的過程中,將反應(yīng)的分子smiles作為輸入,反應(yīng)條件作為標(biāo)簽,生成所述反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集。

31、作為一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦裝置的優(yōu)選方案,所述反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集生成模塊中,在生成所述反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集的過程中,將反應(yīng)及反應(yīng)條件的分子smiles作為輸入,反應(yīng)產(chǎn)率作為標(biāo)簽,生成所述反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集。

32、作為一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦裝置的優(yōu)選方案,所述反應(yīng)條件推薦獲取模塊中,所述反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型的預(yù)測(cè)子模塊包括:

33、特征表示生成子模塊,用于通過化學(xué)信息學(xué)工具對(duì)目標(biāo)反應(yīng)中的反應(yīng)物分子和產(chǎn)物分子進(jìn)行處理,生成所述反應(yīng)物分子的化學(xué)信息學(xué)特征和所述產(chǎn)物分子的化學(xué)信息學(xué)特征;將所述反應(yīng)物分子的化學(xué)信息學(xué)特征和所述產(chǎn)物分子的化學(xué)信息學(xué)特征進(jìn)行融合,生成反應(yīng)的特征表示;

34、反應(yīng)分子圖及特征矩陣生成子模塊,用于構(gòu)建反應(yīng)物和產(chǎn)物的分子圖,將若干分子圖通過鄰接矩陣拼接得到反應(yīng)的分子圖;提取分子中每個(gè)原子的化學(xué)特征,組成與所述反應(yīng)的分子圖相對(duì)應(yīng)的特征矩陣;

35、全局表示獲取子模塊,用于將分子的化學(xué)信息學(xué)特征通過多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)處理,獲得基于分子的全局表示;

36、局部表示獲取子模塊,用于將所述反應(yīng)的分子圖及所述特征矩陣輸入多層圖卷積網(wǎng)絡(luò),通過聚合學(xué)習(xí)所述反應(yīng)的分子圖中原子之間的局部鄰居信息;將聚合后的原子表示通過平均池化層處理,得到基于原子的局部表示;

37、反應(yīng)條件組合生成子模塊,用于將所述全局表示及所述局部表示進(jìn)行組合,并通過若干預(yù)測(cè)層進(jìn)行處理,輸出若干反應(yīng)條件;將若干反應(yīng)條件進(jìn)行排列組合,生成若干反應(yīng)條件組合;

38、溫度預(yù)測(cè)值獲取子模塊,用于將所述反應(yīng)的特征表示通過多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)處理,輸出溫度預(yù)測(cè)值;

39、目標(biāo)反應(yīng)條件獲取子模塊,用于將若干所述反應(yīng)條件組合分別輸入多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行處理,輸出每個(gè)所述反應(yīng)條件組合對(duì)應(yīng)的溫度,獲得目標(biāo)反應(yīng)的若干目標(biāo)反應(yīng)條件。

40、作為一種通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦裝置的優(yōu)選方案,所述反應(yīng)條件推薦獲取模塊中,所述反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型的預(yù)測(cè)子模塊包括:

41、化學(xué)反應(yīng)指紋獲取子模塊,用于根據(jù)目標(biāo)反應(yīng)的分子smiles和反應(yīng)條件的smiles計(jì)算,獲得化學(xué)反應(yīng)指紋;

42、產(chǎn)率歸一化子模塊,用于將產(chǎn)率進(jìn)行歸一化處理;

43、預(yù)測(cè)產(chǎn)率獲取子模塊,用于將所述化學(xué)反應(yīng)指紋輸入多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),得到預(yù)測(cè)的產(chǎn)率。

44、本發(fā)明具有如下優(yōu)點(diǎn):本發(fā)明通過對(duì)原始數(shù)據(jù)集進(jìn)行篩選過濾處理,提取反應(yīng)的分子smiles、反應(yīng)條件和產(chǎn)率,生成樣本數(shù)據(jù)集;將所述樣本數(shù)據(jù)集中同一反應(yīng)擁有若干反應(yīng)條件的樣本進(jìn)行處理,保留產(chǎn)率最大的樣本,生成反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集;將所述樣本數(shù)據(jù)集中同一反應(yīng)擁有若干反應(yīng)條件的樣本進(jìn)行處理,保留全部樣本,生成反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集;基于圖卷積網(wǎng)絡(luò)和非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)建反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型;通過所述反應(yīng)條件數(shù)據(jù)集對(duì)所述反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練,獲得訓(xùn)練好的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型;基于多層非線性神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)建反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型;通過所述反應(yīng)產(chǎn)率數(shù)據(jù)集對(duì)所述反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型進(jìn)行訓(xùn)練,獲得訓(xùn)練好的反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型;將目標(biāo)反應(yīng)的分子smiles輸入所述訓(xùn)練好的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型,通過所述訓(xùn)練好的反應(yīng)條件預(yù)測(cè)模型進(jìn)行預(yù)測(cè)處理,獲得所述目標(biāo)反應(yīng)的反應(yīng)條件組合;將所述目標(biāo)反應(yīng)的分子smiles及所述反應(yīng)條件組合中的分子smiles,逐一輸入所述訓(xùn)練好的反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型,通過所述訓(xùn)練好的反應(yīng)產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型進(jìn)行預(yù)測(cè)處理,獲得所述反應(yīng)條件組合對(duì)應(yīng)的產(chǎn)率;將所述反應(yīng)條件組合對(duì)應(yīng)的產(chǎn)率進(jìn)行排序,將產(chǎn)率最大的反應(yīng)條件組合作為推薦結(jié)果。本發(fā)明提出通過產(chǎn)率預(yù)測(cè)排名的反應(yīng)條件推薦方法,解決目前反應(yīng)條件預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率低導(dǎo)致使用者實(shí)驗(yàn)數(shù)量增加的問題。若預(yù)測(cè)的所有反應(yīng)條件的產(chǎn)率都比較低,說明該反應(yīng)的合成率較差,可以直接放棄對(duì)應(yīng)的路線,這大大減少了使用者需要對(duì)反應(yīng)條件模型預(yù)測(cè)的結(jié)果逐一實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的過程;本發(fā)明通過圖卷積網(wǎng)絡(luò)和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分別建模分子圖和分子指紋,考慮了反應(yīng)的局部變化和全局性質(zhì),有利于提高反應(yīng)條件的準(zhǔn)確性;通過化學(xué)反應(yīng)描述符特征作為產(chǎn)率預(yù)測(cè)模型的輸入特征,能夠有效的捕捉通知反應(yīng)不同反應(yīng)條件之間的變化。

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