本發(fā)明涉及一種基于高通量篩選及復(fù)配功能菌劑的方法,屬于微生物防治菌劑篩選。
背景技術(shù):
1、近年來,在植物病害方向包含化學(xué)防治、物理防治、生物防治等,其中研究熱點為生物防治。病害生物防治既具有經(jīng)濟、無公害、效果長久等優(yōu)點,又符合農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的思路,深受國內(nèi)外研究者的重視。目前,生物防治病害中篩選微生物菌劑具有很好的利用前景,但篩選過程緩慢,受人為操作因素影響較大,菌劑在田間不好定殖,等等問題都嚴(yán)重制約了生物防治的規(guī)?;茝V和應(yīng)用。有必要對此進(jìn)行研究改進(jìn)。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、基于上述,本發(fā)明提供一種基于高通量篩選及復(fù)配功能菌劑的方法,能夠快速、高效地篩選出防效好的復(fù)配菌劑。
2、本發(fā)明的技術(shù)方案是:基于高通量篩選及復(fù)配功能菌劑的方法,包括以下步驟:
3、s1選擇高通量篩選菌株的營養(yǎng)底物,即菌株功能靶標(biāo);
4、s2以營養(yǎng)底物為唯一碳/氮源,通過高通量篩選法快速分散、分離、培養(yǎng)單一功能菌株;
5、s3根據(jù)第一重要性狀對所有功能菌株進(jìn)行高低排序,得到a={a1,a2,a3…am}定義解空間;
6、s4從排序結(jié)果中選擇前n株菌株作為初解s0={a1,a2…an};
7、s5以菌株間相容性為篩選標(biāo)準(zhǔn),得到不同的解s,并選擇n值最大的s作為復(fù)配功能菌劑組合,所述n值為解s中第一重要性狀的評價指標(biāo)。
8、優(yōu)選的,步驟s2中,通過高通量篩選法快速分散、分離、培養(yǎng)單一功能菌株的方法如下:
9、s21以營養(yǎng)底物為唯一碳/氮源,配制無機鹽培養(yǎng)基;
10、s22將無機鹽培養(yǎng)基轉(zhuǎn)移至96孔細(xì)胞培養(yǎng)板中;
11、s23將功能菌株接種于細(xì)胞培養(yǎng)板中,當(dāng)渾濁孔占有總孔數(shù)的28~32%時,取孔中培養(yǎng)液于分離培養(yǎng)基上培養(yǎng),將長出的菌株作為單一功能菌株;
12、其中,所述無機鹽培養(yǎng)基中營養(yǎng)底物的濃度為最佳的稀釋濃度,在最佳的稀釋濃度條件下,將菌株分離到細(xì)胞培養(yǎng)板的一個培養(yǎng)孔中,經(jīng)過培養(yǎng)一段時間后,會出現(xiàn)渾濁反應(yīng)的孔數(shù)約占總孔數(shù)的30%。
13、細(xì)菌菌株高通量篩選方法是基于數(shù)學(xué)上的泊松分布原理,即在odc條件下,從根系中提取一個單個細(xì)菌分離到細(xì)胞培養(yǎng)板的一個培養(yǎng)孔中,經(jīng)過培養(yǎng)一段時間后,會呈現(xiàn)渾濁反應(yīng)的孔數(shù)約占總孔數(shù)的30%。當(dāng)約30%的孔變得渾濁,即顯示微生物生長,此稀釋濃度稱為“最佳的稀釋濃度(optimal?dilution?concentration,odc)。
14、優(yōu)選的,所述最佳的稀釋濃度采用數(shù)學(xué)二分查找法獲得。
15、優(yōu)選的,在步驟s4中,在得到初解s0后,以是否具有第二重要性狀作為篩選參數(shù),從s0中剔除不具有第二重要性狀的菌株,并用a中后續(xù)排名中具有第二重要性狀的菌株進(jìn)行替換。
16、優(yōu)選的,步驟s5中,判斷兩菌株之間是否存在相容性的方法為:將功能菌株兩兩垂直交叉劃線接種于培養(yǎng)基上,在兩菌的相交處出現(xiàn)不生長說明菌間具有不相容性;反之,為兩株細(xì)菌之間相容。
17、本發(fā)明的有益效果:本發(fā)明首先通過高通量篩選和排序,可以快速從大量菌株中獲得靶向菌株,大大縮短了篩選時間,在復(fù)配時通過綜合考慮菌株的重要性狀及相容性,能夠確保選出的菌株組合在功能上是最優(yōu)的,并且可以避免不兼容菌株的組合,有助于保證復(fù)配菌群的穩(wěn)定性和協(xié)同作用,從而在實際應(yīng)用中達(dá)到最佳的效果。
1.基于高通量篩選及復(fù)配功能菌劑的方法,其特征在于,包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于高通量篩選及復(fù)配功能菌劑的方法,其特征在于,步驟s2中,通過高通量篩選法快速分散、分離、培養(yǎng)單一功能菌株的方法如下:
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的基于高通量篩選及復(fù)配功能菌劑的方法,其特征在于,所述最佳的稀釋濃度采用數(shù)學(xué)二分查找法獲得。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于高通量篩選及復(fù)配功能菌劑的方法,其特征在于,在步驟s4中,在得到初解s0后,以是否具有第二重要性狀作為篩選參數(shù),從s0中剔除不具有第二重要性狀的菌株,并用a中后續(xù)排名中具有第二重要性狀的菌株進(jìn)行替換。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于高通量篩選及復(fù)配功能菌劑的方法,其特征在于,步驟s5中,判斷兩菌株之間是否存在相容性的方法為:將功能菌株兩兩垂直交叉劃線接種于培養(yǎng)基上,在兩菌的相交處出現(xiàn)不生長說明菌間具有不相容性;反之,為兩株細(xì)菌之間相容。