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用于使用質譜裝置來進行多反應監(jiān)測的方法與流程

文檔序號:40748051發(fā)布日期:2025-01-21 11:38閱讀:43來源:國知局
用于使用質譜裝置來進行多反應監(jiān)測的方法與流程

本發(fā)明公開了一種用于使用質譜技術,具體是液相色譜和質譜來進行多反應監(jiān)測的方法和裝置。


背景技術:

1、相對于某些其他分析方法,質譜(ms)系統(tǒng)因其高分辨率和分析相對較小樣品體積的能力而廣泛應用于生物學樣品的分析。作為分析工作流程的一部分,質譜系統(tǒng)可聯接到液相色譜(lc)分離系統(tǒng)。諸如體液等復雜樣品可注入lc分離系統(tǒng)并分離成順序洗脫的組分,然后在ms系統(tǒng)上進行分析這些組分。lc分離和基于ms的選擇性分析的組合,可實現對不同的樣品進行定量分析。

2、質量軸的不穩(wěn)定性,即質量準確度和分辨率的漂移,可能是由溫度和濕度中的一者或多者的改變、ms污染以及質量軸校準之間的較長時間內質量軸的漂移引起的。這可能會因以下而妨礙lc-ms方法:由于目標分析物的較低離子傳輸和檢測而降低靈敏度,以及由于與分析物具有相似理化性質(即相似lc保留時間和多反應監(jiān)測(mrm)躍遷)的樣品基質組分的相對較高離子傳輸和檢測而降低選擇性。維持lc-ms方法對質量軸不穩(wěn)定性的靈敏度的常見策略是降低ms分辨率。然而,此策略可能會因以下而降低方法選擇性:損害方法將來自樣品基質組分的信號與分析物信號區(qū)分的能力。

3、wo?2021/140178?a1描述了一種用于分析生物學樣品的系統(tǒng),該系統(tǒng)包括分離單元,該分離單元被配置成從生物學樣品分離組分;電離單元,該電離單元被配置成從組分生成多個離子;可調節(jié)的質量選擇過濾元件;檢測器,該檢測器被配置成檢測穿過質量選擇過濾元件的離子;以及控制器,該控制器與質量選擇過濾元件以及與檢測器連接??刂破鞅慌渲檬沟迷谙到y(tǒng)的操作期間,控制器調整質量選擇過濾元件并激活檢測器以測量與多個離子相對應的至少三個不同離子信號,并且基于該至少三個不同離子信號來確定系統(tǒng)的質量軸偏移。

4、wo?2021/239692?a1描述了一種用于針對定量因子-定性因子比率校驗來校準客戶質譜儀器的計算機實現的方法。該方法包括以下步驟:a)至少一個制造商現場標準化,其中受試者的一組樣品以及一組校準品樣品是在多個質譜儀器上以多次重復測量的,其中每個測量包括對分析物和內標物的定量因子和定性因子躍遷的多反應監(jiān)測,其中至少三個調整因子是從受試者的該一組樣品以及該一組校準品樣品的測量結果中確定的,其中第一調整因子取決于分析物與內標之間的差異,其中第二調整因子取決于受試者的樣品與校準品樣品之間針對分析物定量因子-定性因子比率的差異,其中第三調整因子取決于受試者的樣品與校準品樣品之間針對內標物定量因子-定性因子比率的差異;b)至少一個轉移步驟,其中調整因子是以電子方式轉移至客戶質譜儀器的;c)至少一個客戶現場校準,其中客戶現場校準包括至少一個校準測量,其中一組校準品樣品是在客戶質譜儀器上測量的并且定量因子-定性因子比率是從其確定的,其中定量因子-定性因子比率的針對分析物以及針對內標物的目標值是通過對確定的定量因子-定性因子比率應用調整因子來設置的。

5、待解決的問題

6、因此,本發(fā)明的目的是提供用于多躍遷監(jiān)測的方法和裝置,其避免了已知方法和裝置的上述缺點。特別地,該方法和該裝置會改善以下項:維持lc-ms方法對質量軸不穩(wěn)定性的靈敏度和選擇性。


技術實現思路

1、這個問題通過具有獨立權利要求的特征的用于多躍遷監(jiān)測的方法和裝置來解決。在從屬權利要求中公開了本發(fā)明的優(yōu)選實施方案,其可以以單獨方式或以任何任意組合來實現。

2、如下文所使用,術語“具有”、“包含”或“包括”或它們的任意語法變型以非排他性方式使用。因此,這些術語既可以指除了由這些術語引入的特征之外,在此上下文中描述的實體中不存在其他特征的情況,也可以指存在一個或多個其他特征的情況。作為示例,表述“a具有b”、“a包括b”和“a包含b”既可以指其中除b之外,a中不存在其他要素的情況(即,其中a由b單獨且唯一地組成的情況);也可以指其中除b之外,實體a中還存在一個或多個其他要素(諸如要素c、要素c和要素d或甚至其他要素)的情況。

3、進一步地,如下文所使用,術語“優(yōu)選地”、“更優(yōu)選地”、“特別地”、“更特別地”、“具體地”、“更具體地”或類似的術語與任選特征結合使用,而不限制替代性的可能性。因此,由這些術語引入的特征是任選特征,并且不旨在以任何方式限制權利要求的范圍。如技術人員將認識到的,本發(fā)明可以通過使用替代性特征來進行。類似地,由“在本發(fā)明的一個實施例中”引入的特征或類似表述旨在成為任選特征,而對本發(fā)明的替代性實施例沒有任何限制、對本發(fā)明的范圍沒有任何限制,并且對將以這種方式引入的特征與本發(fā)明的其他任選或非任選特征相組合的可能性也沒有任何限制。

4、在本發(fā)明的第一方面,公開了一種用于使用質譜裝置來進行多躍遷監(jiān)測的方法。

5、該方法包括以下步驟,作為示例,可按照給定順序進行以下步驟。然而,應當注意,不同的順序也是可能的。進一步地,還可以一次或重復進行一個或多個方法步驟。進一步,可同時或以適時重合的方式進行兩個或更多個方法步驟。該方法可以包括未列出的其他方法步驟。

6、所述方法包括以下步驟:

7、i)通過使用質譜裝置,利用交錯多反應監(jiān)測來測量內標物和分析物兩者的定量因子和定性因子的多反應監(jiān)測躍遷,其中該交錯多反應監(jiān)測包括至少三個多反應監(jiān)測通道組,其中該多反應監(jiān)測通道組中的一個以內標物和分析物兩者的定量因子和定性因子的相應理論m/z值進行測量,并且另外兩個多反應監(jiān)測通道組以向較高值和較低值偏移預定義水平的相應m/z值進行測量;

8、ii)通過使用至少一個處理裝置將內標物的多反應監(jiān)測躍遷的至少兩個定量因子/定性因子比率與來自數據庫的參考值進行比較,其中該比較包括確定定量因子/定性因子比率與參考值之間的偏差;

9、iii)在針對定量因子/定性因子比率中的至少一個的偏差在至少一個預定義容差范圍內的情況下,通過使用處理裝置從分析物和內標物經測量的多反應監(jiān)測躍遷中確定測量結果,在其他情況下拒絕經測量的多反應監(jiān)測躍遷。

10、如上所述,該方法可以使用交錯多反應監(jiān)測。這可以允許維持lc-ms方法對質量軸不穩(wěn)定性的靈敏度和選擇性。

11、該方法可以為計算機實現的。如本文所用,術語“計算機實現的方法”是廣義的術語且被賦予對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于涉及至少一臺計算機和/或至少一個計算機網絡的方法。計算機和/或計算機網絡可以包括至少一個處理器,該至少一個處理器經配置用于進行根據本發(fā)明的方法的方法步驟中的至少一個方法步驟。優(yōu)選地,每個方法步驟由計算機和/或計算機網絡進行。該方法可完全自動地(具體地,在沒有用戶交互的情況下)進行。如本文所用,術語“自動地”和“自動”是廣義的術語且應被賦予對于本領域普通技術人員而言其普通且慣常的含義,并且不應限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于完全借助于至少一臺計算機和/或至少一個計算機網絡和/或至少一臺機器來進行的過程,特別地,不需要手動操作和/或與用戶交互。

12、如本文所使用,術語“多反應監(jiān)測”(mrm),也表示為多躍遷監(jiān)測,是廣義的術語且將被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體地可指但不限于在質譜中特別是在串聯質譜中使用的方法,其中對來自一個或多個前體離子的多個產物離子進行監(jiān)測。如本文所使用,術語“監(jiān)測”是廣義的術語且將被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體地可指但不限于對多個產物離子的確定和/或檢測。

13、如本文所用,術語“質譜”是廣義的術語,且將被賦予對于本領域普通技術人員普通和慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于用于確定離子的質荷比的分析技術。可使用至少一個質譜裝置進行質譜分析法。如本文所用,術語“質譜裝置”,也稱為“質量分析儀”,是廣義的術語且被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體地可指但不限于經配置用于基于質荷比來檢測至少一種分析物的分析儀。

14、質譜裝置可以為或可以包括至少一個四極桿分析儀。如本文所用,術語“四極桿質量分析儀”是廣義的術語且被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于包括至少一個四極桿作為濾質器的質量分析儀。四極桿質量分析儀可包括多個四極桿。例如,四極桿質量分析儀可為三重四極桿質譜儀。例如,質譜裝置可以包括:電離源,截取器(skimmer),以及三個四極桿級q1、q2和q3,以及檢測器。四極桿級q1、q2和q3中的每一個都包括四極桿。

15、如本文所用,術語“濾質器”是廣義的術語且被賦予對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于經配置用于根據離子的質荷比m/z來選擇注入到濾質器的離子的裝置。濾質器可包括兩對電極。電極可為桿狀的,特別是柱形的。在理想情況下,電極可為雙曲線的。電極可被設計為相同的。電極可布置為沿公共軸例如z軸平行延伸。四極桿質量分析儀可包括至少一個電源電路,該至少一個電源電路經配置用于在濾質器的該兩對電極之間施加至少一個直流(dc)電壓和至少一個交流(ac)電壓。電源電路可經配置用于保持每個相對電極對處于相同的電位。電源電路系統(tǒng)可以被配置用于周期性地改變電極對的電荷極性,使得僅在某個質荷比m/z內的離子才可能具有穩(wěn)定的軌跡。濾質器內的離子的軌跡可通過mathieu微分方程來描述。為了測量具有不同m/z值的離子,可以及時改變dc電壓和ac電壓,使得可以將具有不同m/z值的離子傳輸到質譜裝置的檢測器。

16、質譜裝置可以進一步包括至少一個電離源。如本文所使用,術語“電離源”,也稱為“離子源”或“電離器”,是廣義的術語且將被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于被配置用于例如從氣體、液體或固體樣品生成分子離子的裝置。電離源可以為或可以包括選自由以下各項組成的組的至少一個源:至少一個氣相電離源,諸如至少一個電子電離(ei)源或至少一個化學電離(ci)源;至少一個解吸電離源,諸如至少一個等離子體解吸(pd)源、至少一個快速原子轟擊(fab)源、至少一個二次離子質譜(sims)源、至少一個激光解吸(ld)源以及至少一個基質輔助激光解吸電離(maldi)源;至少一個噴霧電離源,諸如至少一個熱噴霧(tsp)源、至少一個大氣壓化學電離(apci)源、至少一個電噴霧(esi)以及至少一個大氣壓電離(api)源。

17、質譜裝置可包括至少一個檢測器。如本文所用,術語“檢測器”是廣義的術語且被賦予對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于經配置用于檢測輸入離子的設備。檢測器可經配置用于檢測帶電粒子。檢測器可為或可包括至少一個電子倍增器。質譜裝置,特別是質譜裝置的檢測器和/或至少一個處理單元,可以經配置以確定經檢測的離子的至少一個質譜圖。如本文所用,術語“質譜圖”是廣義的術語且被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于信號強度相比質荷比m/z的二維表示,其中該信號強度對應于相應離子的豐度。質譜圖可為像素化的圖像。為了確定質譜圖像素的所得強度,可對用檢測器檢測到的在一定的m/z范圍內的信號進行積分。樣品中的分析物可以通過處理單元來識別。具體地,處理單元可以經配置用于將已知的質量與經識別的質量相關聯或通過特征裂解模式來配置。

18、質譜裝置可為或可包括液相色譜質譜裝置。質譜裝置可以連接到和/或可以包括至少一個液相色譜儀,也表示為液相色譜(lc)裝置。液相色譜儀可用作質譜裝置的樣品制備。樣品制備的其他實施例也是可行的,諸如至少一臺氣相色譜儀。如本文所用,術語“液相色譜質譜裝置”是廣義的術語且被賦予對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于液相色譜與質譜的組合。質譜裝置可包括至少一臺液相色譜儀。液相色譜質譜裝置可為或可包括至少一種高性能液相色譜(hplc)裝置或至少一種微流液相色譜(μlc)裝置。液相色譜質譜裝置可包括液相色譜(lc)裝置和質譜(ms)裝置,在當前情況下為濾質器,其中l(wèi)c裝置和濾質器經由至少一個接口耦接。耦接lc裝置和ms裝置的接口可包括電離源,該電離源經配置用于生成分子離子以及將分子離子轉移到氣相中。接口可進一步包括布置在電離源與濾質器之間的至少一個離子遷移模塊。例如,離子遷移模塊可為高場不對稱波形離子遷移譜(faims)模塊。

19、如本文所用,術語“液相色譜(lc)裝置”是廣義的術語且被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于分析模塊,該分析性模塊被配置成將樣品的一種或多種目的分析物與樣品的其他組分分離,以用于利用質譜裝置來檢測一種或多種分析物。lc裝置可包括至少一個lc柱。例如,lc裝置可為單柱lc裝置或具有多個lc柱的多柱lc裝置。lc柱可具有固定相,流動相被泵送穿過該固定相,以便分離和/或洗脫和/或傳輸目標分析物。液相色譜質譜裝置可進一步包括樣品制備工位,該樣品制備工位用于樣品的自動化預處理和制備,每個樣品包括至少一種目標分析物。

20、質譜裝置可以被配置用于進行端到端工作流程(也表示為樣品測量工作流程),其中樣品被注入到液相色譜柱的入口中,樣品在柱上被分離成組分,并且各個組分從柱中洗脫。洗脫的組分被引導到質譜儀中,在那里它們被離子化和分析。質譜儀測量與每種組分相關聯的離子碎片化模式。每個離子碎片化模式由一個或多個峰組成,這些峰對應于具有特定m/z比的離子碎片。特定分析物的峰模式(例如,峰的m/z比和強度)有效地充當分析物的“指紋”。由于碎片化模式的復雜性,可基于這些測量來鑒定和量化各種各樣的組分。通常,通過將測量的離子碎片化模式與參考信息(例如,已知組分的先前測量或模擬的離子碎片化模式)進行比較來執(zhí)行鑒定。也可執(zhí)行特定組分的鑒定基于初始引入樣品(例如,注入lc-ms系統(tǒng)的入口)和組分從lc柱洗脫之間的時間間隔,或初始引入樣品和測量質譜儀中的組分離子碎片化模式的時間間隔。某些組分可以特定的速率遷移通過lc色譜柱,并且經過的時間間隔可用作組分身份的指標。與離子碎片化模式一樣,可以將經過的時間間隔與參考信息(例如,已知組分的先前測量的遷移和/或測量時間)進行比較,以確定組分的身份。

21、可以在隨機訪問模式下操作質譜裝置。如本文所使用,術語“隨機訪問模式”是廣義的術語且將被賦予其對于本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于隨機且連續(xù)地對樣品進行上樣的操作模式。隨機訪問模式可以包括對樣品進行完全自動的上樣。隨機訪問模式可以進一步包括在質譜裝置上徹底和/或完全自動地進行樣品測量工作流程。這可以允許顯著地增加吞吐量。

22、如本文所用,術語“樣品”是廣義的術語且被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于任意測試樣品,諸如生物學樣品。質譜裝置可以被配置用于測量多種生物學樣品。此類樣品的示例包括但不限于生理學流體,包括血液、血清、血漿、尿液、汗液、唾液、眼晶狀體液、腦脊髓液、乳汁、腹水、粘液、滑液、腹膜液、羊水、淋巴液、間質液、腦脊液、組織、細胞等。樣品可以包含一種或多種目的分析物,也表示為目標分析物。樣品可在從相應來源獲得時直接使用,或者可經過預處理和/或樣品制備工作流程。例如,可通過加入內部標準和/或通過用另一種溶液來進行稀釋和/或通過與試劑等進行混合來預處理該樣品。例如,一般來講,目標分析物可為維生素d、濫用藥物、治療藥物、激素和代謝物。關于樣品的相應進一步細節(jié),參考例如ep3?425?369?a1,其全部公開內容通過引用包含在本文中。其他目標分析物也是可能的。

23、如本文所使用,術語“內標物”(istd)是廣義的術語且將被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于已知量的物質。當經歷使用質譜裝置的工作流程時,內標物可以展現與目的分析物相似的性質。工作流程可以包括任何預處理、富集和實際檢測步驟,如上文所描述。例如,內標物可以是目的分析物的同位素標記的變體(包含例如2h、13c或15n等標記物)。

24、如本文所使用,術語“定量因子”,也表示為定量離子,是廣義的術語且將被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于用于對分析物進行定量的躍遷。定量因子可以是豐度最大的離子。如本文所使用,術語“定性因子”,也表示為定性離子,是廣義的術語且將被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于用以確認測量的另外的躍遷。如本文所使用,術語“定量因子/定性因子比率”是廣義的術語且將被賦予其對于本領域普通技術人員普通和慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于定量因子和定性因子的信號強度比率或峰面積比率。

25、如本文所使用,術語“交錯多反應監(jiān)測”(s-mrm)是廣義的術語且將被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于使用一組交錯的m/z值(例如理論m/z值以及向較高值和較低偏移預定義水平的m/z值)的多反應監(jiān)測。預定義水平可以被指定為質量軸關于相關m/z范圍的最大預期漂移的一半。其他水平下的附加測量也是可能的。

26、交錯多反應監(jiān)測包括至少三個多反應監(jiān)測通道組。如本文所使用,術語“多反應監(jiān)測組”是廣義的術語且將被賦予其對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于使用相同m/z值在q1和q3處測量的mrm躍遷中的一個或多個。多反應監(jiān)測通道組中的一個以內標物和分析物兩者的定量因子和定性因子的相應理論m/z值進行測量,并且另外兩個多反應監(jiān)測通道組以向較高值和較低值偏移預定義水平的相應m/z值進行測量。例如,s-mrm可以在q1和q3處使用目標分析物的針對所有mrm躍遷優(yōu)化的ms分辨率??梢詼y量第一mrm躍遷集,其包括分析物和內標物兩者在其相應目標m/z值處的定量因子和定性因子mrm躍遷。此外,可以測量在q1和q3處向較高m/z值偏移的第二mrm躍遷集,并且可以測量在q1和q3處向較低m/z值偏移的第三mrm躍遷集。因此,可以測量目標分析物的總共六個mrm躍遷以及內標物的總共六個mrm躍遷。例如,該方法可以包括以下測量:

27、

28、

29、步驟ii)包括通過使用至少一個處理裝置將內標物的多反應監(jiān)測躍遷的至少兩個定量因子/定性因子比率與來自數據庫的參考值進行比較。

30、如本文所用,術語“處理裝置”是廣義的術語且被賦予對于本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體地可以指但不限于經配置成用于進行計算機或系統(tǒng)的基本操作的任意邏輯電路系統(tǒng);和/或,一般而言,經配置用于進行計算或邏輯運算的裝置。處理裝置可以經配置用于處理驅動計算機或系統(tǒng)的基本指令。作為示例,處理裝置可以包括至少一個算術邏輯單元(alu)、至少一個浮點單元(fpu)(諸如數學協(xié)處理器或數值協(xié)處理器)、多個寄存器(具體地是被配置用于向alu供應運算數并存儲運算結果的寄存器)以及存儲器(諸如l1和l2高速緩沖存儲器)。處理裝置可以為多核處理器。處理裝置可以是或可以包括中央處理單元(cpu)。另外地或替代性地,處理裝置可以為或可以包括微處理器,因此,具體地,處理器的元件可以包含在一個單一集成電路(ic)芯片中。另外地或替代性地,處理裝置可以為或可以包括一個或多個專用集成電路(asic)和/或一個或多個現場可編程門陣列(fpga)和/或一個或多個張量處理單元(tpu)和/或一個或多個芯片,諸如專用機器學習優(yōu)化芯片等。處理裝置可以被配置(諸如通過軟件編程)用于進行一個或多個評估操作。處理裝置可以被配置用于進行指定的方法步驟。因此,作為示例,處理裝置可以包括存儲在其上的軟件代碼,該軟件代碼包括多個計算機指令。處理裝置可以提供用于進行指示的操作中的一個或多個的一個或多個硬件元件,和/或可以向一個或多個處理器提供在其上運行的用于進行方法步驟中的一個或多個的軟件。

31、如本文所用,術語“數據庫”是廣義的術語且被賦予對于本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體地可以指但不限于通常從計算機或計算機系統(tǒng)以電子方式存儲和訪問的有組織的數據集合。數據庫可包括數據存儲裝置,或者可由數據存儲裝置組成。數據庫可包括至少一個數據庫管理系統(tǒng),該數據庫管理系統(tǒng)包括在計算機或計算機系統(tǒng)上運行的軟件,該軟件允許與用戶、應用程序或數據庫本身中的一者或多者進行交互,諸如以便捕獲和分析包含在該數據庫中的數據。數據庫管理系統(tǒng)可以進一步涵蓋用以管理數據庫的設施。因此,包含數據的數據庫可由數據庫系統(tǒng)組成,該數據庫系統(tǒng)除了包括數據之外,還包括一個或多個相關聯的應用程序。

32、數據庫可以為處理裝置的一部分或者可以在處理裝置的外部。處理裝置可以包括至少一個通信接口。通信接口可以被配置用于進行以下中的至少一者:從處理裝置傳輸數據或向處理裝置傳輸數據或在處理裝置內傳輸數據。如本文所用,術語“通信接口”是一個廣義術語且被賦予對本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不限于特殊或自定義的含義。該術語具體地可以指但不限于形成邊界的物項或元件,該邊界經配置用于傳輸信息。特別地,通信接口可配置成用于傳輸來自計算裝置(例如計算機)的信息,諸如將信息發(fā)送或輸出到例如另一裝置上。附加地或另選地,通信接口可配置成用于將信息傳輸到計算裝置上(例如傳輸到計算機上),諸如,以便接收信息。通信接口可具體地提供用于傳輸或交換信息的途徑。特別地,通信接口可提供數據傳輸連接,例如藍牙、nfc、電感耦合等。作為示例,通信接口可以是或可包括至少一個端口,該端口包括網絡或internet端口、usb端口和磁盤驅動器中的一者或多者。通信接口可以包括至少一個web接口。

33、處理裝置和/或數據庫可以是至少部分基于云的。如本文所使用,術語“基于云的”是廣義的術語且將被賦予其對于本領域普通技術人員而言普通且慣常的含義,并且不應限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于將處理裝置或處理裝置的部分外包給至少部分互連的外部裝置,具體是具有較大計算能力和/或數據存儲量的計算機或計算機網絡。外部裝置可以是任意地空間分布的。外部裝置可以隨著時間的推移而變化,具體是按需變化。外部裝置可以通過使用互聯網來互連。外部裝置可以各自包括至少一個通信接口。

34、如本文所使用,術語“參考值”是廣義的術語且將被賦予對于本領域普通技術人員而言其普通且慣常的含義,并且不應限于特殊或自定義的含義。該術語具體可以指但不限于目標m/z處內標物的預定義和/或預測量的定量因子/定性因子比率。數據庫可以包括由以下各項組成的組中的至少一種信息:分析物id、樣品基質id、儀器id、方法或測定id、內標物的平均定量因子/定性因子比率。從這些信息中的一種或多種中,處理裝置可以確定參考值。

35、步驟ii)可以包括將內標物的在步驟i)中測量的多反應監(jiān)測躍遷的所有定量因子/定性因子比率與參考值進行比較。

36、附加地或替代地,在步驟ii)中可以進行選擇。步驟ii)可以包括根據內標物定量因子的多反應監(jiān)測躍遷的信號強度來選擇內標物的多反應監(jiān)測躍遷的兩個定量因子/定性因子比率。步驟ii)可以包括將內標物的多反應監(jiān)測躍遷的經選擇的定量因子/定性因子比率與參考值進行比較。步驟ii)可以包括比較內標物定量因子的多反應監(jiān)測躍遷的信號強度。例如,步驟ii)可以包括比較內標物定量因子的三個mrm躍遷的信號強度。信號強度的比較可以通過執(zhí)行軟件算法來進行。

37、在質量軸穩(wěn)定(即最小或無漂移)的情況下,多反應監(jiān)測通道組使用針對目標分析物和istd的相應m/z值進行測量將產生最高信號強度。在質量軸顯著漂移至較高或較低m/z值的情況下,其他多反應監(jiān)測通道組中的一個將產生最高信號強度。

38、步驟ii)可以包括拒絕具有最低信號強度的多反應監(jiān)測躍遷。例如,步驟ii)可以包括選擇三個內標物mrm躍遷中具有最高信號強度的兩個并拒絕具有最低信號強度的mrm躍遷。

39、內標物的多反應監(jiān)測躍遷的定量因子/定性因子比率的比較包括確定定量因子/定性因子比率與參考值之間的偏差。步驟ii)可以包括將內標物的其余多反應監(jiān)測躍遷的定量因子/定性因子比率與參考值進行比較。比較可以包括至少一個數學運算。

40、根據步驟ii)中的比較的結果,在步驟iii)中可以進行不同動作。在針對定量因子/定性因子比率中的至少一個的偏差在至少一個預定義容差范圍內的情況下,步驟iii)包括通過使用處理裝置從分析物和內標物經測量的多反應監(jiān)測躍遷中確定測量結果。預定義容差范圍可以為參考值的±15%,優(yōu)選地±10%,更優(yōu)選地±5%。測量結果的確定可以通過執(zhí)行軟件算法來進行。測量結果可以為或者可以包括至少一種定量信息,例如關于樣品中的分析物的值。測量結果可能為最終患者結果。根據確定的偏差,例如標志,測量結果可以進一步包括關于質量軸的穩(wěn)定性的品質信息。

41、在其他情況下,即在沒有任何定量因子/定性因子比率的偏差在預定義容差范圍內的情況下,步驟iii)包括拒絕經測量的多反應監(jiān)測躍遷。步驟iii)可以進一步包括將數據標志為異常值。步驟iii)可以包括校驗內標物的兩個其余mrm躍遷的定量因子/定性因子比率,并拒絕與參考值的偏差超出至少一個預定義容差范圍的任意者。

42、例如,如果與其余多反應監(jiān)測躍遷的定量因子/定性因子比率中的僅一個的偏差在預定義容差范圍內,則步驟iii)包括從與定量因子/定性因子比率相對應的多反應監(jiān)測通道組的分析物和內標物的多反應監(jiān)測躍遷中確定測量結果。例如,可以使用滿足條件的多反應監(jiān)測通道組的分析物和內標物的單個mrm躍遷集通過分析物mrm/istdmrm來計算最終患者結果。步驟iii)可以包括拒絕與參考值的偏差超出預定義容差范圍的任意多反應監(jiān)測通道組。

43、例如,如果針對其余多反應監(jiān)測躍遷的兩個定量因子/定性因子比率的偏差均在預定義容差范圍內,則步驟iii)可以包括使用其余多反應監(jiān)測躍遷的總和從分析物和內標物確定測量結果。為了確定測量結果,可以使用滿足條件的與所述定量因子/定性因子比率相對應的多反應監(jiān)測通道組的分析物和內標物的多反應監(jiān)測躍遷。例如,滿足條件的監(jiān)測通道組的分析物和內標物躍遷可以記為第一分析物mrm、第二分析物mrm、第一istdmrm和第二istdmrm。總和可由以下確定

44、

45、兩個交錯mrm躍遷集的總和可以產生較高的靈敏度。步驟iii)可以包括拒絕與參考值的偏差超出預定義容差范圍的任意多反應監(jiān)測通道組。

46、例如,在未進行選擇的情況下并且如果針對多反應監(jiān)測躍遷的定量因子/定性因子比率中的每一個的偏差均在預定義容差范圍內,則步驟iii)可以包括使用多反應監(jiān)測躍遷的總和從分析物和內標物確定測量結果。因此,為了確定測量結果,可以使用所有多反應監(jiān)測通道組的分析物和內標物的多反應監(jiān)測躍遷。例如,監(jiān)測通道組的分析物和內標物躍遷可以表示為第一分析物mrm、第二分析物mrm、第三分析物mrm、第一istdmrm和第二istdmrm、第三istdmrm??偤涂捎梢韵麓_定

47、

48、三個交錯mrm躍遷集的總和可以產生較高的靈敏度。

49、方法步驟i)至iii)可以通過使用至少一個計算機來進行。具體地,步驟i)中的測量的控制和進行可以完全自動地進行。此外,步驟ii)和iii)中的數據采集和評估可以完全自動地進行。具體地,該方法可以完全或部分地是計算機實現的,具體地在計算機(諸如處理器)上實現。

50、在另一方面,公開了一種計算機程序,其包括計算機可執(zhí)行指令,該計算機可執(zhí)行指令用于當程序在計算機或計算機網絡、具體是處理裝置上執(zhí)行時,進行根據本文所述的實施例中的任一項的方法、具體是方法步驟i)至iii)。具體地,計算機程序可以存儲在計算機可讀數據載體上和/或計算機可讀存儲介質上。

51、如本文所用,術語“計算機可讀數據載體”和“計算機可讀存儲介質”具體地可以指非暫時性數據存儲器件,諸如具有存儲在其上的計算機可執(zhí)行指令的硬件存儲介質。計算機可讀數據載體或存儲介質具體地可以為或者可以包括諸如隨機存取存儲器(ram)和/或只讀存儲器(rom)等存儲介質。

52、因此,具體地,可通過使用計算機或計算機網絡,優(yōu)選地通過使用計算機程序來進行如上文所指示的方法步驟i)至iii)中的一個、多于一個或甚至所有的步驟。

53、本文進一步公開并提出了一種具有程序代碼工具的計算機程序產品,以便在計算機或計算機網絡上執(zhí)行該程序時,在本文所附的一個或多個實施例中執(zhí)行根據本發(fā)明的方法。具體地,程序代碼工具可以存儲在計算機可讀數據載體上和/或計算機可讀存儲介質上。

54、本文進一步公開并提出了一種數據載體,其具有存儲在其上的數據結構,該數據載體在加載到計算機或計算機網絡中之后,諸如在加載到計算機或計算機網絡的工作存儲器或主存儲器中之后,可以執(zhí)行根據本文所公開的一個或多個實施例的方法。

55、本文進一步公開和提出了一種包括指令的非暫時性計算機可讀介質,該指令當由一個或多個處理器執(zhí)行時,使該一個或多個處理器進行根據本文公開的實施例中的一個或多個的方法。

56、本文進一步公開并提出了一種具有存儲在機器可讀承載件上的程序代碼工具的計算機程序產品,以便在計算機或計算機網絡上執(zhí)行該程序時,執(zhí)行根據本文所公開的一個或多個實施例的方法。如本文所用,計算機程序產品是指作為可交易產品的程序。產品一般可以任意格式(諸如以紙質格式)存在或者存在于計算機可讀數據載體上和/或計算機可讀存儲介質上。具體地講,計算機程序產品可以分布在數據網絡上。

57、本文進一步公開并提出了一種包含可由計算機系統(tǒng)或計算機網絡讀取的指令的調制數據信號,用于進行根據本文所公開的一個或多個實施例的方法。

58、參考本發(fā)明的計算機實現的方面,可以通過使用計算機或計算機網絡來進行根據本文所公開的一個或多個實施例的方法的一個或多個方法步驟或甚至所有方法步驟。因此,一般來講,可以通過使用計算機或計算機網絡來執(zhí)行包括提供和/或操縱數據的任何方法步驟。一般來講,這些方法步驟可以包括通常除需要手動操作(諸如提供樣品和/或執(zhí)行實際測量的某些方面)的方法步驟之外的任何方法步驟。

59、具體地,本文進一步公開以下內容:

60、-計算機或計算機網絡,其包括至少一個處理器,其中處理器被適配成進行根據本說明書中所描述的實施例之一的方法,

61、-計算機可加載數據結構,其被適配成當在計算機上執(zhí)行數據結構時,進行根據本說明書中所描述的實施例之一的方法,

62、-計算機程序,其中該計算機程序適于當在計算機上執(zhí)行該程序時,進行根據本說明書中所描述的實施方案中的一個的方法,

63、-計算機程序,其包括程序裝置,該程序裝置用于當在計算機上或在計算機網絡上執(zhí)行該計算機程序時,進行根據本說明書中所描述的實施方案中的一個的方法,

64、-計算機程序,該計算機程序包括根據前述實施方案的程序裝置,其中該程序裝置存儲在計算機可讀的存儲介質上,

65、-存儲介質,其中數據結構存儲在該存儲介質上并且其中該數據結構適于在被加載到計算機或計算機網絡的主存儲器和/或工作存儲器中之后,進行根據本說明書中所描述的實施方案中的一個的方法,以及

66、-一種計算機程序產品,其具有程序代碼工具,其中該程序代碼工具能夠被存儲或被存儲在存儲介質上,以用于如果在計算機或計算機網絡上執(zhí)行該程序代碼工具,則執(zhí)行根據本說明書中所描述的實施例之一的方法。

67、在本發(fā)明的另一方面,公開了一種用于對樣品中的至少一種分析物進行多躍遷監(jiān)測的系統(tǒng)。

68、該系統(tǒng)包括:

69、-至少一個質譜儀裝置,其被配置用于利用交錯多反應監(jiān)測來測量內標物和分析物兩者的定量因子和定性因子的多反應監(jiān)測躍遷,其中該交錯多反應監(jiān)測包括至少三個多反應監(jiān)測通道組,其中該多反應監(jiān)測通道組中的一個以內標物和分析物兩者的定量因子和定性因子的相應理論m/z值進行測量,并且另外兩個多反應監(jiān)測通道組以向較高值和較低值偏移預定義水平的相應m/z值進行測量;

70、-至少一個數據庫,其被配置用于存儲至少一個參考值;

71、-至少一個處理裝置,其被配置用于將內標物的多反應監(jiān)測躍遷的至少兩個定量因子/定性因子比率與來自數據庫的參考值進行比較,該比較包括確定定量因子/定性因子比率與參考值之間的偏差,其中該處理裝置被配置用于在偏差在至少一個預定義容差范圍內的情況下從分析物和內標物經測量的多反應監(jiān)測躍遷中確定測量結果,并且在其他情況下拒絕經測量的多反應監(jiān)測躍遷。

72、該系統(tǒng)可以被配置用于進行根據本發(fā)明的用于進行多反應監(jiān)測的方法。因此,關于定義和實施例,參考上面的或如下文更詳細描述的對方法的描述。

73、總結并且不排除其他可能的實施例,可以設想以下實施例:

74、實施例1.一種用于使用質譜裝置來進行多反應監(jiān)測的方法,該方法包括以下步驟:

75、i)通過使用質譜裝置,利用交錯多反應監(jiān)測來測量內標物和分析物兩者的定量因子和定性因子的多反應監(jiān)測躍遷,其中該交錯多反應監(jiān)測包括至少三個多反應監(jiān)測通道組,其中該多反應監(jiān)測通道組中的一個以內標物和分析物兩者的定量因子和定性因子的相應理論m/z值進行測量,并且另外兩個多反應監(jiān)測通道組以向較高值和較低值偏移預定義水平的相應m/z值進行測量;

76、ii)通過使用至少一個處理裝置將內標物的多反應監(jiān)測躍遷的定量因子/

77、定性因子比率中的至少兩個與來自數據庫的參考值進行比較,其中

78、該比較包括確定定量因子/定性因子比率與參考值之間的偏差;

79、iii)在針對定量因子/定性因子比率中的至少一個的偏差在至少一個預定義容差范圍內的情況下,通過使用處理裝置從分析物和內標物經測量的多反應監(jiān)測躍遷中確定測量結果,在其他情況下拒絕經測量的多反應監(jiān)測躍遷。

80、實施例2.根據前述實施例所述的方法,其中該預定義水平被指定為質量軸關于相關m/z范圍的最大預期漂移的一半。

81、實施例3.根據前述實施例中任一個所述的方法,其中該預定義容差范圍為參考值的±15%,優(yōu)選地±10%,更優(yōu)選地±5%。

82、實施例4.根據前述實施例中任一個所述的方法,其中步驟ii)包括根據內標物定量因子的多反應監(jiān)測躍遷的信號強度來選擇內標物的多反應監(jiān)測躍遷的兩個定量因子/定性因子比率。

83、實施例5.根據前述實施例所述的方法,其中步驟ii)包括將內標物的多反應監(jiān)測躍遷的經選擇的定量因子/定性因子比率與參考值進行比較。

84、實施例6.根據前兩個實施例中任一個所述的方法,其中步驟ii)包括比較內標物定量因子的多反應監(jiān)測躍遷的信號強度,其中步驟ii)包括拒絕具有最低信號強度的多反應監(jiān)測躍遷,其中步驟ii)進一步包括將內標物的其余多反應監(jiān)測躍遷的定量因子/定性因子比率與參考值進行比較。

85、實施例7.根據前述實施例所述的方法,其中在與其余多反應監(jiān)測躍遷的定量因子/定性因子比率中的一個的偏差在預定義容差范圍內的情況下,步驟iii)包括從與定量因子/定性因子比率相對應的多反應監(jiān)測通道組的分析物和內標物的多反應監(jiān)測躍遷中確定測量結果。

86、實施例8.根據實施例6所述的方法,其中步驟iii)包括在針對其余多反應監(jiān)測躍遷的兩個定量因子/定性因子比率的偏差在預定義容差范圍內的情況下,使用其余多反應監(jiān)測躍遷的總和從分析物和內標物確定測量結果。

87、實施例9.根據前三個實施例中任一個所述的方法,其中步驟iii)包括在其他情況下拒絕與參考值的偏差超出預定義容差范圍的任意者。

88、實施例10.根據前述實施例中任一個所述的方法,其中該數據庫包括由以下各項組成的組中的至少一種信息:分析物id、樣品基質id、儀器id、方法或測定id、內標物的平均定量因子/定性因子比率。

89、實施例11.根據前述實施例中任一個所述的方法,其中該質譜裝置在隨機訪問模式下操作,其中樣品被隨機且連續(xù)地上樣。

90、實施例12.根據前述實施例中任一個所述的方法,其中該質譜裝置為三重四極桿質譜裝置。

91、實施例13.根據前述實施例中任一項所述的方法,其中該方法是計算機實現的。

92、實施例14.一種用于對樣品中的至少一種分析物進行多躍遷監(jiān)測的系統(tǒng),

93、該系統(tǒng)包括:

94、-至少一個質譜儀裝置,其被配置用于利用交錯多反應監(jiān)測來測量內標物和分析物兩者的定量因子和定性因子的多反應監(jiān)測躍遷,其中該交錯多反應監(jiān)測包括至少三個多反應監(jiān)測通道組,其中該多反應監(jiān)測通道組中的一個以內標物和分析物兩者的定量因子和定性因子的相應理論m/z值進行測量,并且另外兩個多反應監(jiān)測通道組以向較高值和較低值偏移預定義水平的相應m/z值進行測量;

95、-至少一個數據庫,其被配置用于存儲至少一個參考值;

96、-至少一個處理裝置,其被配置用于將內標物的多反應監(jiān)測躍遷的至少兩個定量因子/定性因子比率與來自數據庫的參考值進行比較,該比較包括確定定量因子/定性因子比率與參考值之間的偏差,其中該處理裝置被配置用于在所述偏差在至少一個預定義容差范圍內的情況下從所述分析物和所述內標物經測量的多反應監(jiān)測躍遷中確定測量結果,并且在其他情況下拒絕所述經測量的多反應監(jiān)測躍遷。

97、實施例15.根據前述實施例的用于進行多躍遷監(jiān)測的系統(tǒng),其中該系統(tǒng)被配置用于進行根據前述方法實施例中的任一個所述的用于進行多反應監(jiān)測的方法。

98、實施例16.一種包括指令的計算機程序,當所述程序由根據涉及系統(tǒng)的前述實施例中任一個所述的系統(tǒng)上的處理裝置執(zhí)行時,該指令使系統(tǒng)進行根據涉及方法的前述實施例中任一個所述的方法。

99、實施例17.一種包括指令的計算機可讀存儲介質,當該指令由根據涉及系統(tǒng)的前述實施例中任一個所述的系統(tǒng)上的處理裝置執(zhí)行時,指令使系統(tǒng)進行根據涉及方法的前述實施例中任一個所述的方法。

100、實施例18.一種包括指令的非暫時性計算機可讀介質,該指令當由一個或多個處理器執(zhí)行時,使該一個或多個處理器進行根據涉及方法的前述實施例中任一項的方法。

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