本發(fā)明屬于生物醫(yī)藥,特別涉及與結(jié)直腸癌預(yù)后相關(guān)的口腔細菌標志物及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、結(jié)直腸癌(crc)是全球死亡率最高的惡性腫瘤之一。盡管多學(xué)科綜合診療技術(shù)已經(jīng)取得了顯著的進步,但由于結(jié)直腸癌遠處轉(zhuǎn)移率高、對化療藥物易產(chǎn)生耐藥和治療后癌癥易復(fù)發(fā),結(jié)直腸癌患者預(yù)后仍然不容樂觀。鑒于個體間術(shù)后結(jié)果和長期預(yù)后的顯著差異,識別可靠的預(yù)后因素對于優(yōu)化治療策略和改善結(jié)直腸癌患者預(yù)后至關(guān)重要。
2、人體口腔微生物群是一個復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng),包含超過770種口腔微生物。有研究發(fā)現(xiàn),口腔微生物與頭頸部腫瘤、食管癌等腫瘤發(fā)生發(fā)展相關(guān)。口腔微生物群變化與結(jié)直腸癌進展及預(yù)后的關(guān)系,目前仍不清楚。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、為了克服上述現(xiàn)有技術(shù)的缺點與不足,本發(fā)明的首要目的在于提供與結(jié)直腸癌預(yù)后相關(guān)的口腔細菌標志物。
2、本發(fā)明從結(jié)直腸癌患者唾液中獲得口腔細菌,并篩選出與結(jié)直腸癌進展相關(guān)的微生物特征,從而提供新的與結(jié)直腸癌預(yù)后相關(guān)的口腔細菌標志物。
3、本發(fā)明的另一目的在于提供口腔細菌作為結(jié)直腸癌的預(yù)后預(yù)測標志物的應(yīng)用。
4、本發(fā)明的再一目的在于提供口腔細菌在制備預(yù)測結(jié)直腸癌預(yù)后情況的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
5、本發(fā)明的再一目的在于提供檢測口腔細菌的試劑在制備預(yù)測結(jié)直腸癌預(yù)后情況的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
6、本發(fā)明的目的通過下述方案實現(xiàn):
7、第一個方面,本發(fā)明提供了與結(jié)直腸癌預(yù)后相關(guān)的口腔細菌標志物。
8、根據(jù)本發(fā)明申請人的深入研究,從結(jié)直腸癌患者唾液中獲得口腔細菌,并篩選出與結(jié)直腸癌進展相關(guān)的微生物特征,從而提供新的與結(jié)直腸癌預(yù)后相關(guān)的口腔細菌標志物。
9、所述的口腔細菌包括纖細彎曲桿菌(campylobacter?gracilis)、口腔奈瑟菌(neisseria?oralis)以及中間密螺旋體(treponema?medium)中的至少一種。
10、第二個方面,本發(fā)明提供了上述口腔細菌作為結(jié)直腸癌的預(yù)后預(yù)測標志物的應(yīng)用。
11、為了確定結(jié)直腸癌患者的口腔微生物群是否可預(yù)測其進展,對結(jié)直腸癌患者進行隨訪,并對其唾液采用16s?rrna基因全長測序,獲取其口腔微生物群數(shù)據(jù)。經(jīng)過數(shù)據(jù)挖掘分析獲得了與結(jié)直腸癌進展相關(guān)的微生物特征口腔細菌,并基于此提供了一個微生物風險評分來預(yù)測結(jié)直腸癌患者的進展風險。
12、進一步的,將口腔微生物風險評分與關(guān)鍵臨床因素相結(jié)合,構(gòu)建了一個具有更高預(yù)測性能的多因素預(yù)后模型,為結(jié)直腸癌患者提供了一種新的預(yù)后評估工具。
13、第三個方面,本發(fā)明提供了檢測口腔細菌的試劑在制備預(yù)測結(jié)直腸癌的預(yù)后情況的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
14、進一步的,所述產(chǎn)品包括試劑盒、試紙、芯片或高通量測序平臺等。
15、進一步的,所述檢測口腔細菌的試劑可檢測口腔細菌的豐度。
16、進一步的,所述檢測口腔細菌的試劑可采用宏基因組測序、16s?rrna測序、qpcr定量檢測的至少一種方法檢測口腔細菌的豐度。
17、進一步的,所述試劑包括樣本dna提取用試劑、宏基因組測序用試劑、16s?rrna測序用試劑或qpcr定量檢測用試劑的至少一種。
18、進一步的,所述檢測口腔細菌的試劑包括檢測口腔細菌的探針、引物或抗體的至少一種。
19、進一步的,所述的引物為檢測口腔細菌標志物的16s?rrna的引物。
20、在符合本領(lǐng)域常識的基礎(chǔ)上,上述各優(yōu)選條件,可以相互組合,得到具體實施方式。
21、本發(fā)明通過深入研究,提供了與結(jié)直腸癌預(yù)后相關(guān)的口腔細菌標志物及其應(yīng)用,結(jié)果發(fā)現(xiàn)部分口腔細菌與結(jié)直腸癌進展顯著相關(guān),從而提供口腔細菌作為結(jié)直腸癌的診斷或預(yù)后標志物的應(yīng)用。其中,口腔奈瑟菌neisseria?oralis和纖細彎曲桿菌campylobactergracilis與結(jié)直腸癌進展風險增加顯著相關(guān),而中間密螺旋體treponema?medium與結(jié)直腸癌進展風險降低顯著相關(guān)。因此,本發(fā)明提供的口腔細菌標志物可有效的預(yù)測結(jié)直腸癌的進展及預(yù)后情況,為結(jié)直腸癌的預(yù)后情況提供了參考依據(jù),為未來結(jié)直腸癌的診治提供一個有前景的靶點和方向。
1.與結(jié)直腸癌預(yù)后相關(guān)的口腔細菌標志物,其特征在于:所述的細菌包括纖細彎曲桿菌campylobactergracilis、口腔奈瑟菌neisseria?oralis以及中間密螺旋體treponemamedium中的至少一種。
2.權(quán)利要求1所述的口腔細菌標志物作為結(jié)直腸癌的預(yù)后預(yù)測標志物的應(yīng)用。
3.檢測口腔細菌的試劑在制備預(yù)測結(jié)直腸癌預(yù)后情況的產(chǎn)品中的應(yīng)用,其特征在于:所述的細菌包括纖細彎曲桿菌campylobactergracilis、口腔奈瑟菌neisseria?oralis以及中間密螺旋體treponema?medium中的至少一種。
4.檢測口腔細菌的試劑聯(lián)合臨床因素的檢測產(chǎn)品在制備預(yù)測結(jié)直腸癌預(yù)后情況的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應(yīng)用,其特征在于:所述臨床因素包括腫瘤分期、神經(jīng)束侵犯和淋巴轉(zhuǎn)移中的至少一種。
6.根據(jù)權(quán)利要求3或4或5所述的應(yīng)用,其特征在于:所述產(chǎn)品包括試劑盒、試紙、芯片或高通量測序平臺。
7.根據(jù)權(quán)利要求3或4或5所述的應(yīng)用,其特征在于:所述檢測口腔細菌的試劑檢測口腔細菌的豐度。
8.根據(jù)權(quán)利要求3或4或5所述的應(yīng)用,其特征在于:所述檢測口腔細菌的試劑采用宏基因組測序、16s?rrna測序、qpcr定量檢測的至少一種方法檢測口腔細菌的豐度。
9.根據(jù)權(quán)利要求3或4或5所述的應(yīng)用,其特征在于:所述試劑包括樣本dna提取用試劑、宏基因組測序用試劑、16s?rrna測序用試劑或qpcr定量檢測用試劑的至少一種。
10.根據(jù)權(quán)利要求3或4或5所述的應(yīng)用,其特征在于:所述檢測口腔細菌的試劑包括檢測口腔細菌的探針、引物或抗體的至少一種。
11.根據(jù)權(quán)利要求10所述的應(yīng)用,其特征在于:所述的引物為檢測口腔細菌的16s?rrna的引物。