本發(fā)明涉及基因工程,尤其是一種黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株及其構(gòu)建方法與應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、黃嘌呤核苷又名9-呋喃核糖-3,9-二氫-1h-嘌呤-2,6-二酮,是由黃嘌呤和糖基組成的核苷,可通過水解反應(yīng)生成黃嘌呤和核苷酸。黃嘌呤核苷作為非平衡細胞動力學(xué)分裂方式的抑制劑,既能實現(xiàn)骨髓間質(zhì)干細胞的分裂方式由非平衡態(tài)向平衡態(tài)轉(zhuǎn)變,又不影響其肝向分化的特性,有助于提高骨髓間質(zhì)干細胞的體外增殖效率,有著廣泛的應(yīng)用空間。黃嘌呤核苷是咖啡堿合成途徑中第一步反應(yīng)的底物,所以在發(fā)酵培養(yǎng)過程中,向發(fā)酵中添加一定濃度的黃嘌呤核苷,并采用加壓方式對所述重組菌細胞進行通透化處理,促重組菌對底物黃嘌呤核苷的吸收,從而可提高咖啡堿的發(fā)酵產(chǎn)量。
2、目前合成黃嘌呤核苷的方法有天然提取法和化學(xué)合成法。天然提取法主要是從生物體中提取純化黃嘌呤核苷,其優(yōu)點是來源廣泛,但同時也存在產(chǎn)率低且花費高等問題;化學(xué)合成法是人工合成黃嘌呤核苷,包括合成黃嘌呤和糖基的化合物,然后將它們連接在一起,其優(yōu)點是原料易得,但制備流程復(fù)雜,對設(shè)備的要求高,產(chǎn)率較低。
3、微生物發(fā)酵法現(xiàn)已經(jīng)被作為大多數(shù)天然小分子產(chǎn)物大規(guī)模生產(chǎn)的主流方式,雖然細胞內(nèi)嘌呤核苷的生物合成路線早已探明,但由于其合成路線較長且合成途徑反饋抑制較為強烈、并受到細胞內(nèi)多方面嚴格調(diào)控,因此目前未有人用發(fā)酵法生產(chǎn)黃嘌呤核苷。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題在于提供一種黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株。
2、本發(fā)明所要解決的另一技術(shù)問題在于提供上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的構(gòu)建方法。
3、本發(fā)明所要解決的另一技術(shù)問題在于提供上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的應(yīng)用。
4、為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明的技術(shù)方案是:
5、一種黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株,為菌株xl8,是以野生型大腸桿菌(e.coli)w3110作為出發(fā)菌株通過基因改造方法獲得的:首先通過在野生型大腸桿菌(e.coli)w3110的基因組yghx位點引入解淀粉芽孢桿菌中的嘌呤操縱子基因pur(ekbcsqlfmnhd),由ptrc啟動子啟動;然后在基因組上敲除嘌呤核苷酸阻遏蛋白基因purr,并在基因組rph和ilvg位點分別引入prpp轉(zhuǎn)酰胺酶的抗反饋變體purfbazk326q和prpp合成酶的抗反饋變體prsecod128a,均由ptrc啟動子啟動;之后在基因組上敲除核苷磷酸化酶基因ppnp和核苷磷酸化酶基因deod,減弱黃嘌呤核苷的降解,并在基因組上mbha位點上整合次天冬氨酸解氨酶基因aspa加強菌株前體物天冬氨酸的供應(yīng),后敲除鳥苷單磷酸(gmp)合成酶基因guaa以阻斷菌株到鳥苷單磷酸(gmp)的支路代謝,使其更多地流向黃嘌呤核苷的合成途經(jīng),最終獲得xl8。
6、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株,所整合的異源的嘌呤操縱子基因pur(ekbcsqlfmnhd)來自于解淀粉芽孢桿菌中,所述嘌呤操縱子基因pur(ekbcsqlfmnhd)的ncbi-geneid為:pure:75094376;purk:75094377;purb:75094378;purc:75094379;purs:75094380;purq:75094381;purl:75094382;purf:75094383;purm:75094384;purn:75094385;purh:75094386;purd:75094387。
7、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株,所述嘌呤核苷酸阻遏蛋白基因purr的ncbi-geneid:945226;所述抗反饋變體purfbazk326q的ncbi-geneid:75094383;所述抗反饋變體prsecod128a的ncbi-geneid:545772;所述核苷磷酸化酶基因ppnp的ncbi-geneid:945048;所述核苷磷酸化酶基因deod的ncbi-geneid:945654;所述次天冬氨酸解氨酶基因aspa的ncbi-gene?id:948658;所述鳥苷單磷酸(gmp)合成酶基因guaa的ncbi-gene?id:947334。
8、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株,所述ptrc啟動子的核苷酸序列如seq?id?no.95所示。
9、上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的構(gòu)建方法,采用crispr/cas9介導(dǎo)的基因編輯技術(shù)對野生型大腸桿菌(e.coli)w3110逐步改造,具體步驟如下:
10、(1)在e.col?i?w3110的基因組yghx位點引入異源的嘌呤操縱子基因pur(ekbcsqlfmnhd)由ptrc啟動子啟動,增強嘌呤代謝途徑的碳代謝流;
11、(2)敲除嘌呤核苷酸阻遏蛋白基因purr,在基因組ilvg和rph位點分別引入解淀粉芽孢桿菌的prpp轉(zhuǎn)酰胺酶的抗反饋變體purfbazk326q和大腸桿菌來源的prpp合成酶的抗反饋變體prsecod128a,均由ptrc啟動子啟動,解除終產(chǎn)物及關(guān)鍵中間產(chǎn)物的反饋抑制作用;
12、(3)在基因組上敲除ppnp基因和deod基因,減弱黃嘌呤核苷的降解;
13、(4)過表達天冬氨酸解氨酶基因aspa,進一步強化黃嘌呤核苷的生物合成途徑;
14、(5)通過敲除guaa基因以阻斷菌株到鳥苷單磷酸(gmp)的支路代謝,使其更多地流向黃嘌呤核苷的合成途經(jīng)。
15、上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株在生產(chǎn)黃嘌呤核苷方面的應(yīng)用。
16、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的應(yīng)用,采用發(fā)酵方法生產(chǎn)黃嘌呤核苷。
17、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的應(yīng)用,將黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株與發(fā)酵培養(yǎng)基接觸,進行發(fā)酵培養(yǎng),制備得到黃嘌呤核苷。
18、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的應(yīng)用,所述發(fā)酵培養(yǎng)包括搖瓶發(fā)酵或者發(fā)酵罐發(fā)酵。
19、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的應(yīng)用,所述搖瓶發(fā)酵時接種量10%-15%,溫度維持在37℃±0.2,220r/min振蕩培養(yǎng),發(fā)酵過程中通過補加25%的氨水來維持ph在7.0;添加60%葡萄糖溶液補充菌體所需的碳源。
20、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的應(yīng)用,所述發(fā)酵罐發(fā)酵的具體步驟如下:
21、(1)菌種活化:將菌種從甘油管接至斜面培養(yǎng)基活化培養(yǎng)11-13h;將菌種從斜面培養(yǎng)基中接至茄形瓶培養(yǎng)基中繼續(xù)活化擴大培養(yǎng)10-12h,培養(yǎng)溫度:37℃;
22、(2)種子培養(yǎng):培養(yǎng)過程ph維持在7.0±0.1,溫度維持在37±0.2℃,溶氧維持在25%-35%,培養(yǎng)至od為10時轉(zhuǎn)接發(fā)酵罐中進行發(fā)酵培養(yǎng);
23、(3)發(fā)酵培養(yǎng):按20%的接種量將種子液接種至發(fā)酵培養(yǎng)基中進行發(fā)酵培養(yǎng),發(fā)酵ph維持在7.0±0.1,溫度維持在37±0.2℃,溶氧維持在25%-30%;培養(yǎng)過程中通過流加80%葡萄糖溶液維持發(fā)酵過程菌體所需的碳源,期間通過添加25%的氨水來調(diào)節(jié)ph維持在7.0±0.1。
24、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的應(yīng)用,采用的斜面培養(yǎng)基和茄形瓶培養(yǎng)基為:牛肉膏10g/l,葡萄糖5g/l,氯化鈉5g/l,蛋白胨10g/l,酵母粉5g/l,黃嘌呤100mg/l,瓊脂粉25g/l,ph調(diào)至7.0-7.2,121℃,20min滅菌。
25、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的應(yīng)用,采用的種子培養(yǎng)基為:葡萄糖30g/l,酵母浸粉5g/l,蛋白胨1g/l,檸檬酸1.25g/l,mgso4·7h2o1.5g/l,kh2po4?3.0g/l,維生素b1(vb1)1mg/l,生物素(vh)1mg/l,鳥嘌呤200mg/l,其余為水。
26、優(yōu)選的,上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株的應(yīng)用,采用的發(fā)酵培養(yǎng)基為:葡萄糖20g/l,酵母浸粉3g/l,蛋白胨1g/l,檸檬酸2g/l,mgso4·7h2o?2g/l,kh2po4?6g/l,feso4·7h2o?20mg/l,mnso410mg/l,維生素b1(vb1)2mg/l,生物素(vh)2mg/l,鳥嘌呤200mg/l,其余為水。
27、上述培養(yǎng)基均可采用標準方法制備獲得。
28、有益效果:
29、上述黃嘌呤核苷生產(chǎn)菌株,通過對野生型大腸桿菌(e.coli)和解淀粉芽孢桿菌(bac?i?l?l?us?amy?l?o?l?iquefac?iens)的嘌呤代謝相關(guān)途徑進行分析,并在底盤微生物野生型大腸桿菌(e.coli)w3110中引入解淀粉芽孢桿菌嘌呤操縱子,敲除黃嘌呤核苷代謝回補途徑及關(guān)鍵分支途徑,解除關(guān)鍵反饋抑制,敲除黃嘌呤核苷分解途徑等相關(guān)分子改造,至此成功構(gòu)建出一株不含質(zhì)粒、從頭合成黃嘌呤核苷的基因工程菌xl8,具有遺傳背景清晰、可持續(xù)改造等優(yōu)點,該菌株發(fā)酵生產(chǎn)黃嘌呤核苷操作簡單、能以廉價碳源直接合成黃嘌呤核苷,具有很好的工業(yè)應(yīng)用前景。