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一種基于半監(jiān)督學習的腦腫瘤分割方法及腦腫瘤分割系統(tǒng)

文檔序號:41843409發(fā)布日期:2025-05-09 18:02閱讀:5來源:國知局
一種基于半監(jiān)督學習的腦腫瘤分割方法及腦腫瘤分割系統(tǒng)

本技術(shù)一般涉及醫(yī)療影像分割,尤其涉及一種基于半監(jiān)督學習的腦腫瘤分割方法及腦腫瘤分割系統(tǒng)。


背景技術(shù):

1、腦腫瘤的早期診斷和精準治療是提高患者生存率和改善生活質(zhì)量的關(guān)鍵。醫(yī)學影像技術(shù)(如磁共振成像,mri)在腦腫瘤的發(fā)現(xiàn)和評估中發(fā)揮了重要作用。通過對醫(yī)學影像數(shù)據(jù)的精確分割,能夠輔助醫(yī)生識別腫瘤區(qū)域,評估腫瘤大小、形態(tài)及位置,為后續(xù)的治療計劃制定和療效監(jiān)測提供可靠依據(jù)。近年來,基于深度學習的自動分割方法在醫(yī)學圖像領域取得了顯著進展,其利用計算機對圖像特征進行自動提取,顯著提高了分割的效率和精度。然而,這些方法通常依賴于大量高質(zhì)量的標注數(shù)據(jù),而醫(yī)學影像數(shù)據(jù)的標注過程復雜且耗費人力,難以滿足臨床實際需求。

2、半監(jiān)督學習技術(shù)為解決上述問題提供了新的可能。通過充分利用大量未標注數(shù)據(jù)與少量標注數(shù)據(jù),半監(jiān)督學習能夠在降低標注成本的同時,顯著提升模型的學習能力。已有的半監(jiān)督方法大多基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡,例如unet及其變體,這使得網(wǎng)絡缺乏對全局特征的關(guān)注。近期,transformer變體在視覺任務中的應用為醫(yī)學圖像分割任務帶來了新的思路。與卷積神經(jīng)網(wǎng)絡不同,transformer能夠更有效地捕獲全局特征,通過自注意力機制建立不同區(qū)域之間的長距離依賴關(guān)系,從而更好地處理腦腫瘤的復雜形態(tài)和模糊邊界,但卻嚴重依賴于大規(guī)模的高質(zhì)量標注數(shù)據(jù)。因此,我們提供一種基于半監(jiān)督學習的腦腫瘤分割方法及腦腫瘤分割系統(tǒng)以解決上述問題。


技術(shù)實現(xiàn)思路

1、鑒于現(xiàn)有技術(shù)中的上述缺陷或不足,期望提供一種提高模型的魯棒性與分割精度的基于半監(jiān)督學習的腦腫瘤分割方法及腦腫瘤分割系統(tǒng)。

2、第一方面,本技術(shù)提供一種基于半監(jiān)督學習的腦腫瘤分割方法,包括以下步驟:

3、獲取mri圖像數(shù)據(jù)集合,對所述mri圖像數(shù)據(jù)集合進行預處理,并按照第一預設比例對預處理后的mri圖像數(shù)據(jù)集合進行劃分,得到訓練數(shù)據(jù)集合和測試數(shù)據(jù)集合;所述mri圖像數(shù)據(jù)集合包括多例模態(tài)圖像數(shù)據(jù);所述訓練數(shù)據(jù)集合包括按照第二預設比例劃分的標注數(shù)據(jù)和未標注數(shù)據(jù);

4、根據(jù)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡和transformer模型,構(gòu)建分割模型;所述分割模型包括cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng);所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)的解碼器均添加有金字塔預測結(jié)構(gòu);

5、將所述訓練數(shù)據(jù)集合和所述測試數(shù)據(jù)集合輸入至所述分割模型,利用所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)分別對相同的所述未標注數(shù)據(jù)進行推理,得到所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)分別對應的第一預測結(jié)果;同時利用所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)分別對相同的所述標注數(shù)據(jù)進行推理,得到所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)分別對應的第二預測結(jié)果;

6、根據(jù)所述標注數(shù)據(jù)和對應的所述第二預測結(jié)果,計算得到所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)分別對應的監(jiān)督損失;根據(jù)兩個所述第一預測結(jié)果分別生成偽標簽并相互指導學習與更新參數(shù),得到優(yōu)化后的分割模型;并基于雙重不確定感知策略,在所述優(yōu)化后的分割模型中根據(jù)所述未標注數(shù)據(jù)和所述標注數(shù)據(jù)生成偽監(jiān)督損失的權(quán)重;

7、基于sgd優(yōu)化算法對所述優(yōu)化后的分割模型的權(quán)重進行更新,迭代預設次數(shù)并保存模型權(quán)重;并利用所述測試數(shù)據(jù)進行測試,得到多個測試權(quán)重,選取測試效果最好的對應的測試權(quán)重作為最優(yōu)權(quán)重。

8、根據(jù)本技術(shù)實施例提供的技術(shù)方案,對所述mri圖像數(shù)據(jù)集合進行預處理,具體包括以下步驟:

9、將每例所述模態(tài)圖像數(shù)據(jù)中的與腦部無關(guān)的背景區(qū)域進行裁剪并對裁剪后的圖像數(shù)據(jù)進行歸一化處理,得到預處理后的mri圖像數(shù)據(jù)集合。

10、根據(jù)本技術(shù)實施例提供的技術(shù)方案,在得到訓練數(shù)據(jù)集合和測試數(shù)據(jù)集合之后,將所述訓練數(shù)據(jù)集合和所述測試數(shù)據(jù)集合輸入至所述分割模型之前,還包括以下步驟:

11、對所述訓練數(shù)據(jù)集合和所述測試數(shù)據(jù)集合的所有數(shù)據(jù)進行進行數(shù)據(jù)增強操作,得到增強后的訓練數(shù)據(jù)集合和測試數(shù)據(jù)集合。

12、根據(jù)本技術(shù)實施例提供的技術(shù)方案,所述cnn子網(wǎng)對應的監(jiān)督損失根據(jù)以下公式計算得到:

13、;

14、其中,為cnn子網(wǎng)對應的監(jiān)督損失,為cnn子網(wǎng)對應的解碼器數(shù)量,為解碼器層數(shù),為交叉熵損失,為dice損失,為第i層解碼器的多尺度預測結(jié)果,為標注數(shù)據(jù)的標簽。

15、根據(jù)本技術(shù)實施例提供的技術(shù)方案,基于雙重不確定感知策略,在所述優(yōu)化后的分割模型中根據(jù)所述未標注數(shù)據(jù)和所述標注數(shù)據(jù)生成偽監(jiān)督損失的權(quán)重,還具體包括以下步驟:

16、對比所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)的最后一層級解碼器預測的dice得分,得到對比結(jié)果,根據(jù)所述對比結(jié)果以及所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)的性能生成第一權(quán)重和第二權(quán)重;

17、根據(jù)所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)相應的預測結(jié)果,確定相應的不確定估計圖,并計算每個預測結(jié)果和多尺度預設平均值之間的kullback-leibler散度,將多個所述kullback-leibler散度求平均再依據(jù)偽標簽將體素分為前景區(qū)域和背景區(qū)域;對所述前景區(qū)域和所述背景區(qū)域分別計算不確定度均值,根據(jù)所述不確定均值和指數(shù)函數(shù)生成第三權(quán)重和第四權(quán)重;

18、利用所述第一權(quán)重、所述第二權(quán)重、所述第三權(quán)重和所述第四權(quán)重作為所述偽監(jiān)督損失的權(quán)重。

19、根據(jù)本技術(shù)實施例提供的技術(shù)方案,還包括以下步驟:

20、基于多尺度一致性約束,分別計算所述cnn子網(wǎng)的第一預測結(jié)果的第一平均值和所述transformer子網(wǎng)的第二預測結(jié)果的第二平均值;

21、根據(jù)所述第一平均值和所述第二平均值,計算得到多尺度一致性損失。

22、根據(jù)本技術(shù)實施例提供的技術(shù)方案,所述輸出損失值根據(jù)以下公式計算得到:

23、;

24、其中,為輸出損失值,為所述cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)的監(jiān)督損失之和,為權(quán)重系數(shù),為第三權(quán)重,為第一權(quán)重,為cnn子網(wǎng)對應的偽監(jiān)督損失,第四權(quán)重,為第二權(quán)重,為transformer子網(wǎng)對應的偽監(jiān)督損失,為多尺度一致性損失。

25、第二方面,本技術(shù)提供一種基于半監(jiān)督學習的腦腫瘤分割系統(tǒng),用于實現(xiàn)上述的一種基于半監(jiān)督學習的腦腫瘤分割方法,所述腦腫瘤分割系統(tǒng)包括:

26、用戶管理模塊,所述用戶管理模塊用于用戶登錄注冊,利用mysql數(shù)據(jù)庫存儲注冊信息并以bcrypt算法加密密碼;

27、數(shù)據(jù)加載模塊,所述數(shù)據(jù)加載模塊用于獲取mri圖像數(shù)據(jù)集合,對所述mri圖像數(shù)據(jù)集合進行預處理;

28、推理模塊,所述推理模塊用于基于sgd優(yōu)化算法對所述優(yōu)化后的分割模型的權(quán)重進行更新,迭代預設次數(shù)并保存模型權(quán)重;并利用所述測試數(shù)據(jù)進行測試,得到多個測試權(quán)重,選取測試效果最好的對應的測試權(quán)重作為最優(yōu)權(quán)重;

29、可視化模塊,所述可視化模塊用于對3d形態(tài)和2d切片進行展示,并支持回看歷史診斷結(jié)果;所述歷史診斷結(jié)果至少包括圖像和對應的批注。

30、由上述技術(shù)方案可知,本技術(shù)至少具有如下有益效果:

31、本技術(shù)提供一種基于半監(jiān)督學習的腦腫瘤分割方法,包括:獲取mri圖像數(shù)據(jù)集合,對mri圖像數(shù)據(jù)集合進行預處理,并按照第一預設比例對預處理后的mri圖像數(shù)據(jù)集合進行劃分,得到訓練數(shù)據(jù)集合和測試數(shù)據(jù)集合;mri圖像數(shù)據(jù)集合包括多例模態(tài)圖像數(shù)據(jù);訓練數(shù)據(jù)集合包括按照第二預設比例劃分的標注數(shù)據(jù)和未標注數(shù)據(jù);根據(jù)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡和transformer模型,構(gòu)建分割模型;分割模型包括cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng);cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng)的解碼器均添加有金字塔預測結(jié)構(gòu);將訓練數(shù)據(jù)集合和測試數(shù)據(jù)集合輸入至分割模型,利用cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng)分別對相同的未標注數(shù)據(jù)進行推理,得到cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng)分別對應的第一預測結(jié)果;同時利用cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng)分別對相同的標注數(shù)據(jù)進行推理,得到cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng)分別對應的第二預測結(jié)果;根據(jù)標注數(shù)據(jù)和對應的第二預測結(jié)果,計算得到cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng)分別對應的監(jiān)督損失;根據(jù)兩個第一預測結(jié)果分別生成偽標簽并相互指導學習與更新參數(shù),得到優(yōu)化后的分割模型;并基于雙重不確定感知策略,在優(yōu)化后的分割模型中根據(jù)未標注數(shù)據(jù)和標注數(shù)據(jù)生成偽監(jiān)督損失的權(quán)重;基于sgd優(yōu)化算法對優(yōu)化后的分割模型的權(quán)重進行更新,迭代預設次數(shù)并保存模型權(quán)重;并利用所述測試數(shù)據(jù)進行測試,得到多個測試權(quán)重,選取測試效果最好的對應的測試權(quán)重作為最優(yōu)權(quán)重。

32、在數(shù)據(jù)利用方面,本技術(shù)采用半監(jiān)督學習策略,將訓練數(shù)據(jù)集合按第二預設比例劃分標注數(shù)據(jù)和未標注數(shù)據(jù),在利用少量標注數(shù)據(jù)的同時,充分挖掘大量未標注數(shù)據(jù)中的信息,有效緩解了標注數(shù)據(jù)稀缺的問題,提升模型性能的同時降低數(shù)據(jù)標注成本。分割模型融合卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(cnn)和transformer模型,構(gòu)建包含cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng)的架構(gòu),cnn子網(wǎng)和所述transformer子網(wǎng)的解碼器均添加有金字塔預測結(jié)構(gòu);cnn擅長提取局部特征,可精準捕捉腦腫瘤的局部細節(jié)信息;transformer則在處理長序列數(shù)據(jù)和全局依賴關(guān)系上表現(xiàn)出色,能從整體把握圖像結(jié)構(gòu),兩者結(jié)合使模型兼顧局部與全局特征,對復雜的腦腫瘤邊界及形狀分割更準確,提升分割精度。在模型架構(gòu)方面,本技術(shù)利用cnn子網(wǎng)和transformer子網(wǎng)對相同未標注數(shù)據(jù)和標注數(shù)據(jù)分別推理,根據(jù)預測結(jié)果計算監(jiān)督損失,并通過生成偽標簽相互指定學習與更新參數(shù)。這種方式促進兩個子網(wǎng)間信息交互,使模型在訓練中不斷優(yōu)化,提高對腦腫瘤特征的學習能力,增強模型的泛化性和穩(wěn)定性?;陔p重不確定感知策略生成偽監(jiān)督損失權(quán)重,根據(jù)未標注數(shù)據(jù)和標注數(shù)據(jù)特點動態(tài)調(diào)整權(quán)重,合理平衡監(jiān)督損失和偽監(jiān)督損失對模型訓練的影響,避免未標注數(shù)據(jù)中錯誤信息過度干擾模型,確保模型在利用未標注數(shù)據(jù)時能穩(wěn)定、有效地學習,進一步提升分割性能。采用sgd優(yōu)化算法更新分割模型的權(quán)重迭代預設次數(shù)并保存模型權(quán)重;并利用所述測試數(shù)據(jù)進行測試,得到多個測試權(quán)重,選取測試效果最好的對應的測試權(quán)重作為最優(yōu)權(quán)重朝著損失函數(shù)減小方向優(yōu)化,提高訓練效率,快速找到最優(yōu)權(quán)重,減少計算資源消耗和訓練時間。

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